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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  04/11/2019
Data da última atualização:  06/11/2019
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  VIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A.
Afiliação:  MARCOS JOSÉ ANDRADE VIANA, UFMG; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA.
Título:  Plant Co-expression Annotation Tool: a tool to identify targets for proof of concept in Genetically Modified crop breeding pipelines.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 15., 2019, Campos do Jordão. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2019.
Páginas:  p. 42.
Idioma:  Inglês
Notas:  X-Meeting 2019
Conteúdo:  The purpose of this work is to characterize PUFs to be used in GM crops pipelines using orthology, co-expression networks and other tools. To date, we have downloaded, analyzed, and processed genomic data of 53 organisms from Phytozome, as well as the genome of the resurgent Boea Hygrometrica plant from NCBI, totaling 1, 862, 010 genes, 2, 332, 974 mRNA and 2, 332, 974 proteins.
Palavras-Chave:  Bioinformática; Culturas geneticamente modificadas; Genetically Modified crops; Proteínas de função desconhecida; Proteins of unknown function.
Thesaurus Nal:  Bioinformatics; Genetically modified organisms.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/204234/1/Plant-coexpression-XMeeting-2019.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA20117 - 1UPCRA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. Machado: a genomic data integration framework for Chado developed with Django. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 15., 2019, Campos do Jordão. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2019. p. 6. X-Meeting 2019.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. Machado: open source genomics data integration framework. GigaScience, v. 9, n. 9, p. 1-16, Sept. 2020. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; CARVALHO, V.; LECLERCQ, S. Y. Nonclassically secreted proteins as possible antigens for vaccine development: a reverse vaccinology approach. Applied Biochemestry Biotechnology, v. 165, n. 7, p. 3360-3370, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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4.Imagem marcado/desmarcadoALEXANDRE, P. A.; GOMES, R. da C.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Bovine NR1I3 gene polymorphisms and its association with feed efficiency traits in Nellore cattle. Meta Gene, v. 2, p.206-217, 2014
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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5.Imagem marcado/desmarcadoVIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. Plant Co-expression Annotation Resource: a web server for identifying targets for genetically modified crop breeding pipelines. BMC Bioinformatics, v. 22, article 46, 2021. Article 46. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo.
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6.Imagem marcado/desmarcadoVIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. Plant Co-expression Annotation Tool: a tool to identify targets for proof of concept in Genetically Modified crop breeding pipelines. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 15., 2019, Campos do Jordão. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2019. p. 42. X-Meeting 2019
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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7.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; PORTO-NETO, L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A. Construction of gene networks for growth traits and genetic profiling of Nelore beef cattle of Brazil In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS OF MOLECULAR BIOLOGY, 22., 2014, Boston. Boston, ISCB, 2014.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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8.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; TIZIOTO, P. C. PATERNITYHD versão 1.0 - um software para cálculo da probabilidade de exclusão de paternidade com dados de genotipagem em painel de alta densidade de SNPs em bovinos. SÃO CARLOS, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2011. 21 p. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 103)
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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9.Imagem marcado/desmarcadoGONZAGA, A.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; HRUSCHKA, E. Mineração de dados para identificar atributos genéticos associados à características de interesse econômico à pecuária. In: ARBEX, W.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics TACG. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 41-70.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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10.Imagem marcado/desmarcadoGONZAGA, A. DOS S.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; HRUSCHKA, E. R. Mineração de dados para identificar atributos genéticos associados à características de interesse econômico à pecuária. In: ARBEX, A.; MARTINS, N. F.; MARTINS, M. F. Talking about computing and genomics - TACG: modelos e métodos computacionais em Bioinformática. Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 41-70.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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11.Imagem marcado/desmarcadoPAIVA, A. L.; MACHADO, C. R. L.; MUDADU, M. de A.; DINIZ, M. R. V. Preliminary transcriptome analysis of the spider phoneutria pertyi Venom glands and comparison with the transcriptome of the spider phoneutria nigriventer. In: ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN BIOCHEMESTRY AND MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY, 51., 2012, Foz do Uguaçu. Proceedings... Foz do Iguaçu: SSBq, 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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12.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. Imputação de genótipos em bovinos: um guia passo a passo. Campinas: Embrapa informática Agropecuária, 2016. 31 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 143).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul.
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13.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; LAU, E. Y.; PEREIRA, J. F.; MINELLA, E. Genotipagem por meio de marcadores SNP em cevada (Hordeum vulgare): um estudo de caso em cultivares e populações resultantes de retrocruzamentos. Campinas: Embrapa Informática Agropecuaria, 2019. 21 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 164).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite.
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14.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; YAMAZAKI-LAU, E.; PEREIRA, J. F.; MINELLA, E. Genotipagem por meio de marcadores SNP em cevada (Hordeum vulgare): um estudo de caso em cultivares e populações resultantes de retrocruzamentos. Campinas: Embrapa Informática Agropecuaria, 2019. 21 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 164).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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15.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. Genotype imputation of Hereford and Bradford bovine breeds from Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 46. X-meeting 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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16.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. Genotype imputation of Hereford and Bradford bovine breeds from Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 46. X-meeting 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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17.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. de A. C. RPaternity. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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18.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A. Rpaternity. Versão 2.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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19.Imagem marcado/desmarcadoSOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; REDE BIFEQUALI. Aplicação da metodologia de homozigose do haplótipo estendido (EHH) para genes relacionados com crescimento e deposição de gordura em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste.
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20.Imagem marcado/desmarcadoTIZIOTO, P. C.; THOLON, P.; MUDADU, M. de A.; BRESSANI, F. A.; REDE BIFEQUALI; REGITANO, L. C. de A. Análise haplotípica do gene ASAP1 associado com maciez de carne em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste.
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